全国治疗肛门癌比较好的三甲医院有1、复旦大学附属中山医院，2、复旦大学附属华山医院，3、中国中医科学院望京医院，4、北京二龙路医院，5、上海胸科医院等，肛门癌属于，复旦大学附属中山医院疾病医疗设施齐全，在疾病治疗方面有着丰富的经验；复旦大学附属华山医院口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名复旦大学附属中山医院
复旦大学附属中山医院是国家卫生和计划生育委员会预算管理单位，是复旦大学的附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，医院设有除儿科以外的所有科室、综合实力雄厚。心脏、肝癌、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内领先地位。国家临床重点专科18个：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科、重症医学科、肿瘤科、医学影像科、器官移植科、急诊医学科和神经内科。心血管病和肝肿瘤为上海市临床医学中心。
第二名复旦大学附属华山医院
复旦大学附属华山医院创建于1907年，是复旦大学附属综合性教学医院和中国红十字会直属医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，全院共设39个临床医技科室，尤以神经内外科、皮肤科、手外科、中西医结合、传染病科、脊柱和关节外科、肾脏病科、泌尿外科、肾移植、胰腺外科、乳房外科、内分泌科、职业病和风湿科、颌面外科、影像医学和核医学、运动医学、康复医学为特长，其中神经外科、手外科、中西医结合科、泌尿外科、神经内科、传染病学和抗生素、肾病科、心血管科、影像医学和核医学、普外科为国家级重点学科，临床神经医学、手外科为上海市领先学科，神经外科、手外科被命名为上海市临床医学中心。
第三名中国中医科学院望京医院
中国中医科学院望京医院是一所以中医骨伤临床为重点，其他学科同步发展，满足区域医疗及公共卫生需求为主体，以中医骨伤科临床研究基地和中医康复中心建设为方向，中西医并重，内外兼治，急诊及应急服务能力突出，传统与现代诊疗技术相结合的三级甲等中医医院，是国家中医药管理局的直属医院，现包括两个部分：医院本部和骨伤医疗中心。医院本部位于朝阳区花家地街，骨伤医疗中心位于东直门内南小街甲16号。医院荣获 “全国文明单位”、“首都文明单位”、“中央国家机关文明单位”、“首都卫生系统文明单位”等称号。
第四名北京二龙路医院
北京市肛肠医院(北京市二龙路医院)创立于1937年，是一所以治疗肛肠疾病为特色，融医疗、教学、科研、预防为一体的医保定点二级甲等医院。2012年成立了“北京市肛肠疾病研究院”。医院设有肛肠外科、内科、外科、妇科、中医科、口腔科、眼科、五官科、骨科、针灸科、皮科等27个临床科室11个医技科室，下设德胜社区卫生服务中心及七个社区卫生服务站。2012年7月在西城区德外大街16号高科技园区内北院区投入使用，床位总量达到400张，医院建筑总面积3.9万平方米。
第五名上海胸科医院
上海市胸科医院（暨上海交通大学附属胸科医院），创建于1957年，为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院，被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，2004年成为上海市红十字胸科医院。医院先后获得“全国卫生系统先进集体”、“全国无烟单位”、“上海市职业道德建设十佳单位”、“上海市文明单位”八连冠等殊荣。 医院设有10个临床科室... [收起]