昆明市儿童医院综合内科系南市区新院运行后，将老院儿内科优质医疗资源进行整合后设立的。科室编制床位100张，包括2个综合内科病房及1个儿童重症监护室(PICU)。科室拥有一支力量雄厚，高、中、初级职称人员组成的专业技术团队。是中华儿科学会全国青年委员单位，中华急诊医学会儿科学组委员单位，亦是云南省儿科学科带头人和云南省儿科学分会秘书单位。

科室以诊治儿童内科各系统疾病及各种疑难危重病为主。除常见多发病外，对一些不典型重症结核感染、顽固性咳嗽喘息、各种病原引起的脑炎、抽搐、难治性紫癜、呼吸循环衰竭等疑难危重病具有丰富的诊治经验。与重庆医科大学附属儿童医院肾脏免疫科、中山大学附属第六医院遗传代谢性疾病研究中心建立合作关系，可对原发性免疫缺陷病如WAS综合征、严重联合免疫缺陷病、抗体缺陷病等，以及部分遗传代谢性疾病进行筛查和诊断。科室可开展机械通气、镇痛镇静、动静脉压监测、硬膜下穿刺置管、深静脉置管、动脉血气分析、心肺复苏、休克液体复苏、危重症评分等技术。

科室还特别注重科研建设，坚持临床为主，科研并重的发展战略。目前有在研课题2项，国家自然科学基金项目和云南省学科带头人项目各1项，累计科研经费近100万元。并作为全国委员单位，参与由湖南省儿童医院牵头的“十二五”国家支撑计划项目《儿童应急救治相关技术的研究及推广应用》和2项全国多中心临床合作研究。参编专著2部，并正参与《云南省大百科全书》儿科部分的编撰工作。在儿科学核心期刊及SCI杂志发表论文20多篇。科室还是核心期刊《中华实用儿科临床杂志》通讯编委单位，也是昆明医科大学、大理医学院的硕士学位点之一。

科室将本着更深更精、专业专注的精神，团结创新，锐意进取，在医院党政班子的领导下，构建一个“医术高超、医德高尚、百姓信赖、服务一流”的和谐科室，为我院新时期的大发展和我省儿童的健康事业奉献我们最大的力量。