神经内科分为神经内一科和神经内二科神经。内一科始建于1984年,系国家教育部重点学科、吉林大学精品课程教研室。现有主任医师/教授4名、副主任医师/副教授8名、主治医师/讲师4名、医师6名、康复医师2名,医生中博士生导师3人,硕士生导师8人,医学博士13人；主管技师1名；副主任护师/副教授1名、主管护师6名、护师5名、护士45名。
　　神经内科-内一科是省内规模较大的神经内科之一,现有重症监护病房、单人高级病房、普通病房床位共223张,分别设在中日联谊医院总院、新民院区和南湖院区,病房环境幽雅,设施齐全。
　　神经内科-内一科总院病区内设有神经康复室、血氧治疗室和研究室。神经康复室可开展肢体功能、吞咽功能及语言康复、针灸、超声助溶脑血管病治疗；血氧治疗室可开展光量子血氧磁疗法（紫外线充氧自血回输疗法）治疗各类脑血管疾病,2008年在省内率先开展血脂过滤疗法,治疗高血脂症（高粘血症）和急性脑梗死；研究室可开展神经生化、神经免疫以及脑脊液细胞学检查。
　　神经内科-内一科建科以来科室突出脑血管病规范化治疗,并注重一、二级预防和综合治疗,较早开展急性脑梗死静脉溶栓,脑血管造影术和超选择动脉溶栓术,目前在脑血管病介入治疗方面取得了较丰富经验。在脑血管病、癫痫、周围神经病、多发性硬化、重症肌无力、慢性酒精中毒、脑炎、脑囊虫病、糖尿病神经系统并发症及各类神经系统疑难病等的诊断及治疗方面经验丰富,在省内外享有很高声誉。开设头痛、癫痫、帕金森病、痴呆专病门诊。
　　神经内科-内一科与美国、加拿大、日本等国建立了广泛的学术交流,近5年承担并完成国家、部、省级科研课题30项,获卫生部、省科技厅、省卫生厅科技成果12项,省教育厅和吉林大学优秀教学成果奖4项,吉林大学医疗成果奖13项,在国内核心期刊发表科研论文260篇,主编、参编学术著作38部。已培养博士研究生28人,硕士研究生58人,进修生138人。每年承担7年制本硕连读、5年制本科生、护理学院和成人教育学院等多轨道、多层次的教学任务。
　　神经内科-内一科全体医务人员将以精湛的技术、严格的管理竭诚为广大患者提供一流的医疗服务。
　　神经内科-内二科是国家教育部高等院校重点学科。在完成神经病学的医疗、教学、科研工作基础上,突出脑血管病神经介入及微创介入,率先在东北三省开展神经干细胞移植治疗脑梗死后遗症、脑外伤后遗症、脑瘫、脑发育不全、脊髓损伤、脊髓空洞症、多发性硬化、帕金森病、缺血缺氧性脑病、中毒性脑病等神经系统难治性、疑难性疾病,脑梗死动脉留置管治疗术治疗急性脑梗死,在省内有较高声誉,在国内国际处于领先地位。
　　神经内科-内二科现有教授2名、主治医生3名、医师3名,博士生导师1名、硕士生导师2名、博士2名、硕士6名。主管护师3名、护师4名、护士10名。在承担神经疾病诊治工作基础上,突出脑卒中药物规范化治疗及预防、卒中单元、亚低温治疗、颅内血肿微创介入清除术、脑血管造影术、支架成型术、急性超选择动脉溶栓术等。学术方面与日本、韩国有有着广泛的学术交流。科室发表论文50余篇；著书10部。主持或参加卫生部、省科技厅、卫生厅、省中医局、市科委课题10余项。获卫生部科技成果二等奖1项、三等奖项,省科技成果二等奖4项、三等奖6项,获吉大医疗成果奖4项,获医院百万工程项目1项,获吉林省教委教学成果奖3项,获吉林大学教学成果一等奖1项、二等奖1项、三等奖1项。科室承担博士研究生、硕士研究生、本科生、进修生培养,培养硕士研究生16人、博士研究生12人。