北医三院生殖医学中心集医、教、研为一体，是生殖内分泌和不孕症诊治的综合性医疗机构。不仅辅助生殖技术，还在多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、复发性流产及部分遗传性疾病等多种疑难杂症的诊治方面居全国领先国际先进水平，并成为首批卫生部生殖医学临床培训基地，2009年成为北京大学世界卫生组织生殖健康与人口科学合作临床医学基地。年诊治病例人数居全国前列，2010年门诊量超过20万人次。
生殖中心还积极探索宫、腹腔镜微创手术在生殖内分泌疾病和不孕症诊治中的应用。采用宫、腹腔镜治疗子宫内膜异位症、输卵管病变、宫腔病变、多囊卵巢综合征等；此外生殖中心还针对因恶性肿瘤放化疗及其它一些影响生育的问题为患者开展生育力保存的研究和服务。
北医三院生殖中心的临床诊疗和科研水平都达到了国内领先和国际先进水平，成为目前国内至全世界最大的生殖内分泌疾病和不孕症诊治的综合性医疗中心之一。
北医三院生殖医学中心的前身是上个世纪80年代建立直至2000年不足100平米的试管婴儿室，但开展生殖内分泌的基础研究与临床工作则开始于上世纪六十年代。当时北京海淀区八大学院大批女学生闭经，引起了社会和政府的重视。张丽珠教授经过调查和研究明确了发病原因在下丘脑而并非卵巢，是由于重体力劳动和营养不足导致了营养不良性闭经，自此，奠定了北医三院生殖内分泌专业的开端。
早在六十年代，就开展了输卵管结扎手术对卵巢功能影响的研究，并开展后穹隆镜检查盆腔疾病（是最早期的腹腔镜技术）；七十年代，建立了国内最早的生殖内分泌实验室进行了正常月经周期、绝经期、哺乳期闭经、高泌乳素血症、闭经泌乳综合症等内分泌激素测定，对女性生殖内分泌疾病的认识不断深入，大量的患者得到了当时国内最高水平的治疗。八十年代开展了LHRH兴奋实验，采用大剂量LRH滴鼻抑制排卵功能用于内膜异位症的治疗，并开展了雌、孕激素受体测定，研究了在卵泡不同发育阶段子宫内膜和早孕蜕膜中的变化。
世界首例试管婴儿于1978年出生，震撼了整个世界。不久，台湾和香港在全部利用国外设备和技术的情况下也相继诞生了试管婴儿。八十年代初，张丽珠教授根据国外进展结合中国国情，决定开展试管婴儿技术，但当时的条件一穷二白，即没有技术也没有设备，只能土法上马；为了配合试管婴儿工作加强了内分泌实验室建设，建立了细胞遗传室，联合了北京医科大学组胚教研室刘斌教授等。当时用于试管婴儿工作的只是两间小屋（共60平米左右），一间作实验室，另一间用于取卵和胚胎移植；所有的器皿都要彻底刷洗干净，再用烧制的蒸馏水冲洗几十遍；所用的试剂和培养液全部自行配置，测PH值、测渗透压等。在临床治疗方案的制定上，张丽珠教授颇费了一番苦心，最终决定选择有明确盆腔疾患的女性不孕症患者作为对象，开腹治疗盆腔疾病的同时取卵，采用这样的治疗的策略，最大限度地保证了病人的利益，即清除了盆腔疾病，又获得了不孕症治疗的机会。但当时对人卵的形态缺乏了解，于是将装有卵泡液的试管放在保温瓶中由刘平（现生殖医学中心副主任）一路小跑送到组织胚胎，由刘斌教授认卵。在这种情况下，认识了人卵，1984年体外受精成功。
2001年医院根据发展的需要，投资1000余万元将原来的试管婴儿室扩建成今天2500平方米的生殖医学中心，临床和实验室条件大为改观，2004年4月通过卫生部检查，查获准开展常规IVF-ET、ICSI和PGD。
2005年，在陈贵安教授领导下，成功克隆出人胚胎干细胞系，并做了多个方向的诱导分化研究，水平达到国际先进行列。
2005年，陈贵安教授指导培育成功了我国首例也是世界第二例冻卵、冻精和冻胚的“三冻”试管婴儿，成为我国首例试管婴儿诞生后生殖医学界的又一个标志性成就。
目前北医三院生殖中心能够开展该领域中的所有技术，包括宫腔镜和腹腔镜检查和治疗等，2007年又开展了注水腹腔镜手术这一最新技术。另外，对多囊卵巢综合征的临床与基础研究方面，在李美芝教授和乔杰教授的领导下，经过20来年的研究，在多项国家自然科学基金资助下进行了深入的基础和临床研究，诊治水平达到国内领先和国际先进。2006年，乔杰教授获得国家“十一五”科技支撑项目支持，在国内牵头从事多囊卵巢综合征的诊断和治疗标准的研究，将进一步加深对该疾病的认识。
目前，北医三院生殖医学中心得到了卫生部、科技部、中华医学会、北京市卫生局、北大医学部、北医三院以及社会各方的大力支持，在乔杰主任的领导下，制定了中长期战略发展规划，积极培养和引进人才，发挥团队精神，积极团结协作，加强和国内外的强手合作，注重学科交叉，在发展临床技术提高医疗水平更好为患者服务的同时，并重科学研究与教学工作，同时也加强了人文教育与文化建设。
相信在大家共同的努力下，北医三院生殖医学中心的明天将会更加辉煌，我国的生殖医学事业在国内各位专家同道的共同努力下将更加辉煌！