骨伤科是泉州市正骨医院成立最早的科室。也是至今为止泉州市正骨医院的龙头科室，已成功通过验收并成为“泉州市重点骨伤专科”，目前还是“福建省重点骨伤专科”及“全国农村特色专科”的建设单位。承担着国家中医药管理局科研项目和泉州市科技局科研项目各一项。
　　骨伤科共开放病床60张，并独立成立一个门诊治疗室。下设骨伤科、软伤科及整复科三个科室，骨伤科以泉州正骨手法与微创骨伤疗法为特色疗法系统治疗四肢骨干、关节或近关节骨折，软伤科以医武结合的软伤手法治疗各种疑难软伤杂症，整复科主要处理门诊需要整复的各种骨伤疾病。而骨伤科科室又系三个科室中的基础科室与重点科室。在建科中科室始终坚持“以微创理念为指导，创新型骨科之路“为发展的指导思想。40余年来，不断的开拓创新，在继承以”庄子琛“为代表的民间名武术师所创建的医武结合的独特正骨手法的基础上，顺应世界外科发展趋势，引进并创新了一系列新型骨折微创疗法，研制出多种经皮复位器械，提出及整理了介于传统手法复位及现代切开复位的另一种复位体系??经皮器械复位法，有效地解决了广大患者的骨伤疾患。
　　骨伤科坚持“以人为本“的人文思想，以坚强的技术力量为后盾，为患者提供多种多样的治疗方法。在不违反治疗原则及影响治疗疗效的前提下，尽量满足广大骨伤患者的治疗需求。而且各种疗法都以“微创甚至无创” 的原则设计，包括病房环境及护理设施等，处处都体现出“绿色骨伤疗法”的特点。目前该科室关于四肢创伤性骨折所设计的“闭合复位经皮钳夹疗法、闭合复位经皮髓内固定疗法、闭合复位经皮各型支架固定疗法”等微创系列所治疗的患者规模居于全市乃至全省的前列。
　　骨伤科设立出“锁骨骨折、桡骨远端骨折、胫腓骨骨折、跟骨骨折、股骨粗隆间骨折、前臂骨折”六个专病专人负责组，并对六个专病进行了全程的质量管理控制，使每个接受治疗的患者都能够在短期了获得良好的复位及固定，并皆能在4个月内微创取除二次内固定物(手术植入与取出皆无需手术切口疤痕，仅有点状疤痕存留)，大大缩短了患者疗程，保证了专病的疗效，取得了不菲的社会及经济效益。获得了医疗、患者及社会各界的广泛好评，当地新闻媒体上曾多次对该科进行相关的专题报道。
　　骨伤科还拥有强大的专家组力量的支持，与该科长期联系的名院名医遍布全国，如中国中医研究院骨伤研究所孟和教授、辽宁省海城市正骨医院、河南省洛阳市正骨医院、广东省佛山市中医院等等，只要患者有邀请专家的需求，皆能以最快捷的方式帮忙联系并解决其需求。
　　骨伤科仍在发展中，仍在不断地总结及收集完整的病例资料，使整个技术的创新得到持续性的发展，随着整个新微创骨折治疗技术理论系统的逐渐清晰化，目前骨伤科已整理出较系统的理论文字资料，先后于各级刊物上发表论文20余篇，现正筹备配合全院进行相关专著的编写。