性病科是福建省唯一的国家级性病规范化门诊,经卫生部性病专家组考核验收合格,担负我省性病的规范化诊断、治疗、健康教育、培训等工作,并承担多项国际、国内性病、艾滋病项目。科室成立于1988年,是福建省最早成立的性病专科门诊,前身为福建省皮肤病性病防治院性病科,参与了中国-欧盟性病艾滋病项目、卫生部九项目世界银行贷款项目性病艾滋病子项目、中美POL项目的研究,并作为我省规范化性病门诊的样板省内推广。科室现有高级职称2人、中级职称2人、初级职称1人、护士1人,参与省级性病项目科研任务。
　　专科特色：1、性传播感染的规范化诊疗,按国内外最新性病诊疗规范进行病原学诊疗及病征管理,及时准确进行合理治疗。2、难治性性传播感染的综合治疗,特别是肛周、尿道、宫颈及阴道顽固复发的尖锐湿疣、复发性非淋菌性尿道炎、频发性生殖器疱疹的综合治疗疗效显著,接收全省疑难性病患者。3、生殖器部位皮肤病及皮肤妇科、感染性前列腺炎。4、性病咨询、健康教育及性伴防治。5、真菌性、病毒性、细菌性和过敏性皮肤病等。