医院自建立以来即成立了儿科专业，历史悠久，设新生儿科和小儿内科，现有床位82张，专业医护人员50人，其中高级职称10人，（主任医师5人，副主任医师5人），中级职称12人。高级、中级职称中多数曾进修于北京、上海的一流儿童医院以及省厅举办的儿科学习班，2名到美国进修学习1年，每位医师均有丰富的临床经验，在儿科呼吸系统、消化系统、神经系统及新生儿方面均有较深的造诣。2名医师参加福建省援外医疗队，先后到非洲博茨瓦纳工作3年。儿科还承担厦门大学医学院、福建医科大学、福建中医药大学，福建高等医学专科学校等的临床与理论教学和见习实习的带教，有扎实的理论基础及丰富的临床经验，病房护理组为经验丰富的护理人员组成，技术精湛，优质服务，以上这些都为儿科的高效诊疗奠定良好的基础。

2003年成立了福建省新生儿急救中心福州分中心有300平方米的层流病房，设床位26张，至今已成功抢救多例濒临死亡的急、危、重症新生儿婴幼儿抢救成功率达95％以上。如治疗新生婴儿缺氧缺血性疾病、脑瘫、颅内出血后、重症肺炎等；人工呼吸机治疗新生儿及小儿急性呼吸衰竭、多脏器功能衰竭；新生儿窒息的复苏及合并症的抢救；早产低体重儿、异常儿、有并发症等高危儿的处理；新生儿高胆红素血症的监测和光疗；新生儿感染病原学、免疫功能诊断及成份输血。儿内科开展哮喘的免疫检测和过敏原点刺测试；严重感染合并休克或脑病脑疝的抢救；心内膜心肌炎疾病和心律失常的诊治以及儿童心理卫生咨询、脑瘫康复治疗等项目深受病家赞誉。同时努力开展新技术、新项目。近年来发表50多篇论文，受到省内外儿科界重视和好评。

目前该科拥有德国百瑞公司的压缩雾化器，常频及高频呼吸机，心电监护仪，新生儿远红外抢救台，早产儿保暖箱，新生儿黄疸治疗箱，经皮胆红素测量仪，微量输液泵等先进的医疗设备仪器，病房均有智能通话装置、冷暖空调，进行人性化的布置，营造温馨的环境，使患儿如身处儿童乐园的感觉。

儿科全体医护人员齐心协力，努力为广大患儿创造良好的就医环境，以满腔的热情为每一位来院儿童提供最优质的服务，做到耐心、细心，使家属放心。儿科病房分为四组，每组均有2位以上副主任医师负责，为保证医疗质量，该科全体医师每天均有上班查房。全体医务人员文明行医，合理收费。