北京军区总医院普通外科是全军普通外科中心,现为第三军医大学、北京大学医学院等全国著名医科大学的硕士、博士、博士后研究生培养基地,是集临床、科研、教学为一体的综合性科室,科室设备先进、技术力量雄厚,在全军和全国同等专业中具有较高的学术地位和专业水平。普通外科中心下设有：器官移植中心、腔镜微创治疗中心、胃肠疾病治疗中心、乳腺甲状腺疾病中心和肝胆胰脾治疗中心等五大专业学组。主要收治：胃癌、十二指肠癌、结肠癌、直肠癌、小肠癌、甲状腺癌、乳腺癌,胆囊结石,肝癌,门脉高压症等病种。普通外科中心最突出的专业特长为直肠癌保肛术,乳腺癌保乳术,肝移植,胰肾联合移植等手术,在全国处于领先地位。普通外科中心服务宗旨：“以病人为中心,以质量为核心,以科研带动专业发展”,为病人提供优质的医疗服务,优质的护理服务,并在全国内首先实现全程跟踪治疗服务,得到了社会广大患者的好评及认可,也多次受到上级嘉奖,荣立集体三等功3次。