消化内科创建于1986年，随着医院的发展不断成长壮大。特别是2004年以来，学科建设取得了前所未有的跨越式发展，主要医疗指标数倍增长，实现了主持国家级课题（国家自然科学基金）零的突破，对外交流日益扩大，培养研究生多名，发表中英论文40多篇，“炎症性肠病巨噬细胞移动抑制因子基因多态性研究”获浙江省医药卫生科技创新三等奖。学科目前是拥有卫生部消化内镜培训基地、浙江省内镜（腔镜）质控中心和浙江省医学会消化内镜学分会副主任委员的单位，已成为浙江省内消化内科领域有重要影响的学科之一。

学科现有在编医师16名，其中主任医师5名，副主任医师2名、主治医师5名、住院医师4名；博士学历5名、硕士学位6名，研究生学历占68.8%。在编护士20余人，其中主任护师1名，主管护师7名。人才结构合理，专业理论扎实，临床经验丰富，技术力量雄厚。

学科分门诊、病房及内镜三部分，医疗范围囊括各类胃肠疾病和肝胆胰疾病，如消化道出血、消化道肿瘤、幽门螺杆菌感染、慢性胃炎、溃疡病、胃食管反流病、贲门失驰缓症、Barrett食管、脂肪肝、肝硬化、酒精性肝病、药物性肝病、急慢性胰腺炎、胰腺肿瘤、胆胰管结石、胆管炎、溃疡性结肠炎、克隆恩病及功能性胃肠病等疾病。2011年门诊量6.23万人次，出院1648人次，完成各类内镜诊疗1.72万人次，其中EMR、ESD及ERCP等各类内镜治疗1200多人次。

学科的主要特色是利用消化内镜开展临床诊断和治疗。现已开展无痛内镜、色素染色内镜、电子染色内镜、放大内镜、超声内镜、十二指肠镜、单气囊小肠镜、胶囊内镜、幽门螺杆菌感染检测及一系列胃肠胆胰疾病内镜下治疗，如食管静脉曲张硬化治疗、食管狭窄的内镜下扩张和支架安置治疗、消化道早癌/癌前病变内镜下黏膜切除术（EMR）及内镜黏膜下剥离术（ESD）、胃肠息肉内镜下切除术、内镜下胃造瘘术、内镜下小肠营养管安置术、肠梗阻内镜下导管引流及支架植入术、胆总管结石的内镜下乳头切开碎取石、胆总管狭窄的支架再通和引流、超声内镜对胃肠道肿瘤术前TNM分期及可切除性的准确评估，内镜超声引导下细针穿刺活检及治疗等专科诊疗技术。其中，无痛内镜诊疗技术系浙江省内最早开展，迄至2011年已完成3万余例，OMOM胶囊内镜诊断技术、超声内镜引导下细针穿刺活检、消化道早癌/癌前病变电子染色内镜诊断、内镜下黏膜切除术（EMR）及内镜黏膜下剥离术（ESD）治疗，是浙江省内最早或最早开展的单位之一，处于省内领先地位。

学科主持国家自然科学基金1项、科技厅课题1项、卫生厅课题5项，发表论文70多篇，其中SCI收录论文10余篇。“无痛内镜诊疗技术的临床应用”、“国产OMOM胶囊内镜对小肠疾病的诊断价值”、“内镜超声引导下细针穿刺吸取细胞学检查术的应用”、“ERCP支架治疗胆道梗阻”、“内镜下黏膜切除术（EMR）治疗早期消化道肿瘤”、“内镜黏膜下剥离术治疗早期消化道肿瘤（ESD）”及“内镜下胃造瘘术”先后获医院临床新技术、新项目一、二及三等奖，“炎症性肠病巨噬细胞移动抑制因子基因多态性研究”获浙江省卫生厅科技创新奖三等奖。

学科作为浙江大学、温州医学院及浙江中医药大学等高校的消化内科学实习点和浙江省的住院医师规范化培训基地，长期以来培养了一大批本科生、进修生及住院医师；自2006年以来，学科与温州医学院、浙江中医药大学及第四军医大学联合培养硕士研究生7名，博士研究生2名，其中6名已按期顺利毕业，获得相应学位。