广西中医学院第一附属医院肛肠科历史悠久，在上世纪50年代就开始开展中医肛肠病诊治业务，是广西开展大肠肛门病防治工作最早形成规模和规范的肛肠病专科，现为“广西中医肛肠病治疗中心”、“全国中医特色护理优秀科室”。目前拥有全国名老中医一名，广西名中医一名，主任医师2人，副主任医师4人，主治医师3人，住院医师1人，是一支知识结构和年龄层次合理的人才梯队和团队。
　　几十年来，肛肠科在全国名老中医李瑞吉、肖振球等老主任们数十年的临床研究，取得了如下成就。
　　1、提出了一系列的中医肛肠诊治理念，如小儿肛瘘肛周脓肿均应采用挂线治疗；溃疡性结肠炎病机本虚标实，治宜补脾益肾，祛湿行气，活血化瘀；脾虚是痔形成之本等。
　　2、创立了一系列肛肠疑难杂症的中医手术和治疗方式，如消痔注射术治疗内痔处于国内领先水平，治愈率达96%；多区域剥离结扎注射术治疗环状混合痔，突破了一次手术只能切除3个痔块的常规禁锢，居全国领先水平；开窗缝扎术治疗对口痔，为国内首创；肛肠科室研制的中药消痔液行直肠固脱注射术治疗直肠脱垂，一次给药即可治愈，居全国领先水平；瘤体基底硬化疗法治疗直肠海绵状血管瘤，是当前非手术疗法中疗效最好的；管道切除缝合内口挂线引流改道术治疗高位复杂性肛瘘，疗程短、治愈率高、肛门外观及功能无损伤；中医综合护理促进痔术后康复明显加快，居全国领先水平等。
　　3、发明并研制出痔疮外洗液、三黄膏、痔消炎膏、槐角丸、槐花口服液、消痔液、安肠胶囊等院内特色制剂，广泛应用于临床，疗效显著。
　　在继承和发掘老一辈丰富的医药遗产的基础上，肛肠科结合国内外的最前沿理论和先进科技，探索和总结了一套完整的以中医药为主导、中西医结合治疗混合痔、肛裂、脱肛、肛瘘、便秘、大肠肿瘤等肛肠疾病的诊疗方案。并成功开展了肛肠病无痛手术治疗、反复手术复发性肛瘘综合治疗、顽固性肛门坠胀和便秘治疗、重症复杂性痔疮的修复与整形治疗、PPH（痔上黏膜环切钉合术）及TST（选择性痔环切钉合术）手术与技巧研究、肛肠术后并发症综合治疗、采用手术配合中药验方治疗大肠肿瘤、肛门尖锐湿疣、肛管皮肤缺损、肛门直肠狭窄等肛肠科常见疑难顽症科技攻关。
　　近年肛肠科来共承担广西科技公关、广西卫生厅、广西教育厅等研究课题有近20项之多。其中课题成果“多区域剥扎注射术治疗环状嵌顿痔的临床及病理研究”及“中医护理促进痔术后康复的临床研究”均获得广西医药卫生科技适宜推广进步三等奖，“安肠胶囊治疗溃疡性结肠炎临床观察及病理研究”获广西医药卫生科技进步三等奖。
　　肛肠科已拥有多功能肛肠病综合治疗检查仪、肛肠压力检查仪、激光痔疮治疗仪、结肠水疗仪、肛肠熏洗仪等设备。目前年门诊量达10000人次，年手术量近1500例次。