肛肠科成立于2000年，是由肛肠外科、激光室及泌尿专科组成的综合性科室。现有主治医师3人，激光技师1人。分别在北京同仁医院、第四军医大学等知名医院进修学习，每个人都有一套独特的诊疗方法，在治疗中各有所长。开展的业务有：肛肠、泌尿系统的多发病、常见病、男女性病及疑难病症的诊治。肛肠科利用多功能电离子手术治疗机在痔疮手术中的应用疗效显著，有术后创伤小、出血少、痛苦少、病程短等优点；用消痔灵注射和液氮冷冻相结合的方法治疗各种痔瘘取得良好效果；利用液氮定期冷冻治疗直肠肿瘤等取得了满意的疗效；前列腺治疗仪对中老年前列腺疾病的治疗中有疗效高、无痛苦、安全无副作用的优点；肛肠科在结肠肿瘤根治、肛门狭窄、先天性肛门闭锁症的手术治疗方面在白银地区处于领先水平。设备有：多功能电离子手术治疗机、激光治疗机、激光机、离子喷雾机、微波治疗仪、前列腺治疗仪等。