胸外科创建于1987年，2000年被沈阳军区联勤部批准为“沈阳军区胸腔镜微创外科中心”。该科虽建科较晚，但发展迅速，经过20余年的努力，现已成为医疗、教学、科研三位一体的科室，科室展开床位35张，并设有全封闭式的重症监护中心，现有医护人员30人，医生组9人，其中教授、主任医师2人，副主任医师4人，其中有硕士研究生导师4人，有博士学位的5人、硕士学位的3人;并含有高级职称的护理组20人。
　　目前科室在胸腔镜微创外科、肺气肿外科治疗、中晚期肺癌及中晚期食管癌以手术为主的综合治疗方面已形成科室特色和优势，尤其在胸腔镜微创外科技术方面已达到国内和军内领先地位，胸腔镜微创外科手术总例数1800余例，成为全国仅有的几所胸腔镜手术达千例以上医院之一。科室收容人数及手术例数逐年增加，目前收容人数900余人/年，手术500余例次/年，疑难重症手术例数明显增多。肺气肿肺减容手术目前保持了全国先进、全军领先水平。肺移植是治疗终末期肺疾病的唯一有效方法，我科从2004年以来已独立开展了2例同种异体单肺移植，第一例生存期达到了2年4个月，第二例单肺移植患者生存1年半，我科是东北地区最早开展肺移植手术的单位，该病例也是东北地区和全军肺移植存活时间最长的病例，我科肺移植手术已跨入国内先进行列。
　　我科目前承担大连医科大学、锦州医学院硕士研究生培养任务，还承担第四军医大学、大连医科大学及中国医科大学本科实习生的临床教学任务，且年均培养进修生10人。近10年胸外科发表学术论文百余篇，参加《胸外科手术学》、《实用腔镜外科学》、《现代肺癌外科学》等5部著作编写和《Lung Cancer》一书的翻译和审定。“九五”期间和“十五”以来科室先后获军队科技进步二等奖和医疗成果二等奖各1项，三等奖2项，2005年申报军队医疗成果奖1项。“十五”以来争得军队和省科研基金课题6项。
　　2007年，胸外科收容患者900余人次，手术近500余例，医疗毛收入近1400余万元。
　　胸外科目前医生队伍学位高，年龄层次结构合理，后续发展潜力巨大，充分调动每个人的科研及临床工作积极性，为胸外科的未来发展添砖加瓦、贡献力量。
　　“十一五”期间，胸外科将继续以胸腔镜微创技术作为主攻方向，深入开展中晚期肺癌及中晚期食管癌以手术为主的综合治疗的基础及临床研究，突出科室微创技术特色，扩大胸腔镜治疗疾病种类及治疗范围，继续保持胸腔镜技术在东北、全军及全国的领先地位。2011年我科成功开展机器人微创手术3例，开创东北地区机器人胸外科手术的先河。
　　在院领导的支持下，积极创造条件，争取尽快申请进入全国肺脏移植中心，继续开展同种异体肺移植，使更多的患晚期肺气肿、肺纤维化等疾病的患者获得新生，并争取尽快形成一定的移植规模。
　　建立胸外科实验室，形成临床带动基础研究，基础研究推动临床工作的良性循环模式。
　　“十一五”期间，在院领导的支持、扶植及政策倾斜下，争取形成展开床位79+13张，年收容患者2000人次，年手术量达1000例次，并争取使沈阳军区总医院胸外科成为全军胸腔外科诊治中心。