肿瘤内科始建于二十世纪九十年代初, 为安徽省最早独立建制的肿瘤专业学科之一, 具有国务院学位办批准的肿瘤学硕士学位授予权，为皖南医学院弋矶山医院重点学科，2009年由省政府批准为博士后工作站，科室的临床或实验室工作条件均完全具备博士后工作站的需要。
　　肿瘤内科拥有床位104张，月均出院病人数约300人，年均出院病人数约3600人，病床使用率达93%，平均住院天数约9天。科室临床医师共16人，其中教授及主任医师5人，副教授及副主任医师4人，主治医师3人，住院医师4人；其中博士学位2人，硕士学位4人。先后有六人赴国内一流肿瘤专科医院进行为期一年以上的专门进修，并与北京，上海，广州，天津，南京等肿瘤专科医院保持着密切联系和协作，会诊等；与国际结轨，积极关注欧美等发达国家临床肿瘤学进展。科室主持安徽省自然基金项目等科研课题10项，年均发表学术论文10篇以上，其中包括SCI收录的文章。
　　肿瘤内科在硬件技术不断提升的同时，软件条件也得到了很大提高，业务水平渐与省内甚或国内水平相当，开展新技术新疗法，如分子靶向治疗、基因治疗及粒子植入治疗等，提高恶性肿瘤的早期诊断率和综合治疗水平，使得治愈好转率不断提高。具体为：1.参加多中心临床协作及国内抗肿瘤新药临床研究。2.强调抗肿瘤药物临床合理应用，规范临床肿瘤化疗标准，连续4年举办省级或国家级肿瘤分子靶向治疗继续教育学习班，参加学习者均在100人以上。3.提高化疗疗效，改进给药方法，如：便携式输注泵持续静脉滴注化疗，血药浓度监测;胸腹腔闭式引流术及腔内化疗。4.应用细胞保护剂以提高剂量强度的探索性研究;高剂量化疗加细胞因子治疗各种实体瘤;应用小剂量、多疗程化疗治疗有适应症的晚期肿瘤、促红细胞生成素治疗肿瘤病人合并贫血、孕激素治疗癌症食欲不振、恶液质为省内领先水平。5.开展新的靶向治疗，如美罗华治疗恶性淋巴瘤;格列卫治疗胃肠间质瘤;Iressa治疗肺癌;赫赛汀治疗乳腺癌、消化系统肿瘤等。6.PICC深静脉置管，使化疗药物直接输入大静脉，避免对浅表静脉的损伤，减轻化疗不良反应。7.热疗仪的使用，加强控制肿瘤生长。8.合理使用免疫治疗，做到既保证疗效，又提高免疫功能。9.重视姑息治疗，支持治疗，止痛治疗，心理治疗。10. 强调化疗药物的标准剂量强度的同时，注意毒副反应的防治。11.遵循综合治疗的原则，循证地进行个体化治疗，选择最佳的治疗计划。12.坚持治疗与康复相结合，注重提高生活质量。